В отличии от Final Fantasy XIII, о системе боя Final Fantasy Versus XIII известно не так уж много. Игра будет в жанре Action RPG и по стилю сражений скорее всего будет похожа на Kingdom Hearts поскольку игра создается той же командой.

Персонаж манипулирует большим количеством мечей с помощью магии.	Вокруг главного персонажа образован прозрачный щит который не дает противникам его поразить.

В игре будут сочетаться классические мечи и современные виды оружия. Также тут не обойдется без использования магии во время боя. В трейлере E3 2006 видно как вокруг Noctis летают множество мечей, а в трейлере Dengeki 07 видно что Noctis может создавать невидимы щит вокруг себя.